いつまでたってもコマンドを覚えられないので自分用にまとめておく。 tar.gz圧縮解凍(シングルコア) 圧縮 tar -zcvf archive.tar.gz archive 解凍 tar -zxvf archive.tar.gz tar.gz圧縮解凍(マルチコア) 圧縮(8core並列の場合) tar cv archive | pigz -9 -p …

pymatgen.analysis.graphsにnetworkx周りのバグがあったので修正とユニットテストの追加をしてプルリクエストを送った。 github.com OSSにプルリクエストを送って英文で説明するのが初めてだったのでめっちゃググった: sucrose.hatenablog.com github.blog q…

pymatgenのサブモジュールを眺めていたらpymatgen.analysis.dimensionalityという結晶の次元数を調べるモジュールを見つけた。 pymatgen.org 関数の使い方よりもそもそも結晶の次元数とはどのように定義されるか、そしてどのようにそれを計算するかに興味が…

pymatgen.util.plotting.periodic_table_heatmapを使うと周期表の形で元素ごとにある実数値をヒートマップで可視化することができる。 一方、例えば元素ごとにイオン半径を可視化したいときなどは対応する関数がpymatgenにないので自分でいろいろと書かない…